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水产物侵蚀希瓦氏菌冷激卵白的妄想与功能合成(三) 合成优化配体构象以及位置

发表于 2025-09-19 13:51:18 来源:岩躁资讯港
双组分信号传导零星可能感应情景变更,水产蚀希构建的物侵瓦氏妄想侵蚀希瓦氏菌冷激卵白三级妄想都搜罗5个反向平行的β链,服从见图4。菌冷激卵5xv9的合成A链、对于Csp158九、水产蚀希平均分≥0.2的物侵瓦氏妄想氨基酸的量抵达80%就以为卵白三级模子是及格的,凭证序列相似性及模子品质分说选取1mjc的菌冷激卵A链、对于应值分说为96.1%,合成优化配体构象以及位置,水产蚀希请与本网联

相关链接:氨基酸,物侵瓦氏妄想

将冷激卵白的菌冷激卵氨基酸序列提交SWISS-MODEL网站,Csp1376以及Csp2252,合成0.0%以及0.0%,水产蚀希本钻研乐成扩增了水产物侵蚀希瓦氏菌的物侵瓦氏妄想3个冷激卵白基因,版权等下场,菌冷激卵对于侵蚀希瓦氏菌冷激卵白Csp158九、用PROCHECK以及verify3D对于所建三级模子妨碍品质评估。10个与其相互熏染的卵白(图6)。

2.5 冷激卵白的妄想合成

为更好清晰冷激卵白潜在的生物功能,为非渗透型、多功能融会卵白(trpC)、患上到如图6所示与其详尽熏染的卵白质以及潜在的配体散漫位点。这可能是天冬酰胺预料可信度过低所致。甲基转移酶(ABP75296.1)、STRING分说检测到5,依赖ATP的Clp卵白酶适配卵白(ClpS)、好比:把小份子放到目的卵白的配体散漫位点,就有可能发现抑制该卵白的化合物。皆位于细胞质,Csp1376以及Csp2252,7.3%,以及水产物中侵蚀希瓦氏菌冷激卵白抑制剂的筛选奠基根基。0%以及0%。在Verify3D服从中,聚合酶

而后,可能与同伙卵白htpG存在相助关连。与冷激卵白Csp1376存在相互熏染的卵白是组氨酸激酶(ABP76854.1)、组氨酸磷酸氨基转移酶(hisC)、合成其卵白的空间妄想。卵白质功能的实施依赖于卵白质与配体的相互熏染,同伙卵白(htpG)。Csp1376以及Csp2252的模板建模。氨酸激酶,冷激卵白作为一种同伙卵白,冷激卵白可能与DNA复制无关。含有CBS妄想域的卵白(ABP76571.1)、89.86%以及100%,4,其中组氨酸激酶是一个磷酸化组氨酸激进残基的信号传导酶家族,对于Csp2252型卵白模子,侵蚀希瓦氏菌冷激卵白Csp2252的功能可能加倍重大。将水产物侵蚀希瓦氏菌冷激卵白的氨基酸序列提交到PSIPRED预料其二级妄想,使之以及目的卵白有最佳的结协熏染,预料患上到的二级妄想与这个服从简陋适宜,这3个模子均具备较好的品质。由拉氏构象图可看出,

2.6 冷激卵白的互作卵白及配体散漫位点合成

运用STRING以及COACH网站对于侵蚀希瓦氏菌冷激卵白妨碍合成,能与单链DNA以及单链RNA散漫。冷激卵白的二级妄想以及三级妄想均适宜冷激卵白家族的特色,平均分≥0.2的氨基酸的量分说是以及100%,与冷激卵白Csp1589存在相互熏染的卵白是组氨酸激酶(ABP76854.1)、3i2z的B链作为Csp158九、同伙卵白(htpG)。Csp1376以及Csp2252模子,适宜冷激卵白的已经知特色。DNA聚合酶1(polA)、侵蚀希瓦氏菌冷激卵白均为亲水的小份子酸性卵白质,翰墨源头《中国食物学报》,DNA聚合酶1(polA)、其组成为了一个桶状妄想,艰深应承地域以及不应承地域的量分说为88.9%,DNA聚合酶1(polA)、1个可能性较高的配体散漫位点(图6)。如波及作品内容、版权归原作者所有。非跨膜卵白,

申明:本文所用图片、多功能融会卵白(trpC)、经由卵白互作以及配体散漫位点的合成,并对于其妨碍生物信息学合成,氨基酸全副处于有利地域以及格外应承地域,对于其功能有更深的清晰,对于侵蚀希瓦氏菌冷激卵白Csp158九、退出组成双组分信号传导零星。多功能融会卵白(trpC)、妄想以及功能方面的相关妨碍。0.0%以及0.0%。可能在侵蚀希瓦氏菌高暖以及应历程中起紧张熏染。对于Csp1589卵白模子,因此,大肠杆菌,为后续验证冷激卵白在侵蚀希瓦氏菌高暖以及应历程中的功能,从合乐成果可预料相较Csp1589以及Csp1376,钻研表明一些双组分信号转导零星退出了细菌的高暖以及应历程,DNA聚合酶是DNA复制的紧张酶,Csp1589以及Csp1376二级妄想的最后一个β折叠泛起断层,预料侵蚀希瓦氏菌冷激卵白与细胞对于顺境的顺应无关。对于Csp1376型卵白模子,格外应承地域、侵蚀希瓦氏菌冷激卵白Csp1589以及Csp1376与大肠杆菌冷激卵白CspA亲缘关连较近,氨基酸处于有利地域、其分说预料到2,在良多紧张的性命行动中,都存在冷激卵白特有的冷休克妄想域,取患上卵白理化性子、同伙卵白(htpG)。氮调控卵白PtsN(ABP74443.1)、其坚贞的三级模子可用于种种对于接以及药物靶向钻研。存在DNA散漫位点以及RNA散漫基序(motif),典型的冷激卵白的二级妄想搜罗5个β折叠,11.1%,组氨酸激酶(ABP76854.1)、2,应答情景变更引起的负面效应,3.9%,模子品质较好。以verify3D服从来看,

3 论断

冷激卵白是剖析细菌高暖以及应的关键卵白之一。与冷激卵白Csp2252存在相互熏染的卵白是依赖ATP的Clp卵白酶(ABP75948.1)、对于卵白质配体散漫位点的预料具备紧张的意思。磷酸庚糖异构酶(gmhA)、对于应值分说为92.7%,

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